У должника-гражданина нет имущества — но за вознаграждение управляющего платит не заявитель, а сам гражданин

Отсутствие у должника имущества само по себе не является основанием выплатить вознаграждение и возместить расходы управляющего за счёт заявителя. В отличие от юрлица, ликвидируемого после банкротства, гражданин сохраняет возможность и обязанность возместить эти расходы сам.